Comprende la documentación procedente de estos colegios desde su fundación (1536), pasando por su posterior unión y hasta su extinción (1832). Este fondo fue adquirido por la Universidad en 1995.
Estos colegios, sobre todo el de Santa Cruz de la Fe, tienen una gran importancia en la historia de la UGR, ocupando sus miembros en numerosas ocasiones puestos de responsabilidad en la misma, e incluso llegando a tener un sitio reservado en el Claustro.
Resultan de especial interés las series de Expedientes de Limpieza de Sangre de Colegiales y Familiares, que constituyen una importante fuente de información genealógica sobre personajes concretos, y que se extiende desde 1536 hasta 1832.